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3D药效团多样性化合物库
3D-Pharmacophore Based Diversity Library
产品编号: DD5400

ChemDiv 专有的基于3D药效团的多样性库旨在最大化高通量筛选(HTS)活动中针对各种蛋白质靶点的命中识别效率和效果。该库采用战略方法构建,利用蛋白质结合位点内的多样空间几何结构和潜在相互作用点,遵循“Picklock”概念。这一概念旨在创建一个最小化但高度多样化的化合物库,每个化合物都富含潜在的药效团点,如氢键受体(HBA)、氢键供体(HBD)和疏水/亲脂/芳香(HYD/LIPO/ARO)点。这样的设计确保该库能够与任何蛋白质靶点有效结合,从而高效地产生初步命中。

ChemDiv 基于3D药效团的多样性库包含52,000种化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

该库的开发过程涉及多个精细步骤,以优化和增强化合物的选择: 1.对ChemDiv库中超过160万种化合物应用软分子复杂性过滤器(MCFs)和药物相似性过滤器,确保仅考虑具有良好药代动力学和药效学特性的化合物。 2.利用Corina软件为每个分子生成精确的3D构象,为进一步分析提供现实基础。 3.自动构建每个构象的三个不同的三中心药效团假设,重点关注HBA、HBD和HYD/LIPO/ARO等关键药效团特征。 4.对所有生成的药效团假设进行聚类,形成最多样化的3D模型池,代表广泛的分子相互作用。 5.使用这个多样化的药效团模型池进行化合物的计算机筛选,以识别最符合假设药效团结构的化合物。 6.从每个药效团簇中选择最多样化的虚拟命中,确保所选化合物全面覆盖操作化学空间,并可能与目标蛋白质有效相互作用。

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化合物库组成
化合物库信息示例
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Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
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RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
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Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
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ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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Milnacipran hydrochloride BW-A78U Tenovin-6 DL-Normetanephrine hydrochloride Triclocarban CUDC101 Chlorpropham Mestinon Zacopride hydrochloride PF04691502
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L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE
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