3D药效团多样性化合物库

3D-Pharmacophore Based Diversity Library

产品编号： DD5400

ChemDiv’s 3D-Pharmacophore Based Diversity 库包含 52,000 compounds.蛋白质包含在其空间几何形状和小分子化合物的潜在热点/结合点方面不同的结合位点。根据“Picklock”概念，在HTS 活动期间，任何蛋白质都可以应用包含较低数量的潜在药效团点多样性高的化合物的文库，以获得初级命中率。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述

蛋白质具有不同的空间几何结构和潜在的热点/结合点，可与小分子化合物发生结合。根据“Picklock”概念，可以应用一个包含具有潜在药效团点的高多样性化合物的库来获得在高通量筛选（HTS）活动中的初步筛选结果。

具体步骤如下：

对ChemDiv库中的化合物（超过1.6百万个化合物）应用软性最大共同片段（MCFs）和药物样性过滤器。这些过滤器有助于根据结构特征和药物样性的特点缩小化合物选择范围。

对于每个化合物，使用Corina软件生成其三维构象。这一步确保化合物以其三维构象的形式进行表示，这对于准确评估其结合相互作用至关重要。

针对每个化合物的构象，自动构建三个最不相似的三中心药效团假设。这些药效团假设主要关注氢键受体（HBA）、氢键供体（HBD）和疏水/亲脂/芳香（HYD/LIPO/ARO）点。

然后，将所有生成的药效团假设进行聚类，以获得最多样性的三维模型池。

使用该池中的药效团假设对化合物进行计算机筛选。

然后从每个药效团池中选择最多样性的虚拟筛选结果。这些化合物适当地覆盖了所需的化学空间。

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化合物库组成

化合物库信息示例

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Empty	Vadadustat	TAK875	TAK-779	Tegobuvir	RN-1734	BMS-687453	AM211	FT011	BMS754807	AAI101	Empty
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Empty	RPW-24	SRT1720 hydrochloride	INH6	SRT 2183	AMG208	Pentadecanoic acid	Apiopaeonoside	Pemirolast potassium	L-Anserine nitrate salt	Sodium Picosulfate	Empty
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Empty	Lercanidipine	Cobicistat	1-Ethyl-2-benzimidazolinone	ROSIRIDIN	PF-AKT400	Benzyl alcohol	1-Methylnicotinamide chloride	MX69	CVT-10216	LCL161	Empty
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Empty	Tirasemtiv	Roniacol	Rg3039	Z433927330	Desloratadine	CH5132799	5-Bromoindole	Smurf1-IN-A01	Halosulfuron-methyl	Piceatannol	Empty
Empty	100872-83-1	100874-08-6	1009119-64-5	1009119-65-6	100929-71-3	1009298-09-2	1009298-59-2	100929-99-5	1009734-33-1	10097-84-4	Empty
Empty	ML346	SB 4	Daclatasvir	Daclatasvir dihydrochloride	NADPH (tetracyclohexanamine)	AZD8055	Vistusertib	PAβN dihydrochloride	HZ1157	Rotundine	Empty
Empty	1009816-48-1	1009817-63-3	1009820-21-6	100986-85-4	101001-34-7	1010411-21-8	1010-60-2	1011244-68-0	1011301-27-1	1011529-10-4	Empty
Empty	Thiamet G	B-AP15	Silmitasertib	Levofloxacin	Pamicogrel	GSK369796 Dihydrochloride	2-Chloronaphthoquinone	TFAP	Tenovin3	Azvudine	Empty
Empty	101152-94-7	101155-02-6	1011557-82-6	1011-74-1	101-20-2	1012054-59-9	101-21-3	101-26-8	101303-98-4	1013101-36-4	Empty
Empty	Milnacipran hydrochloride	BW-A78U	Tenovin-6	DL-Normetanephrine hydrochloride	Triclocarban	CUDC101	Chlorpropham	Mestinon	Zacopride hydrochloride	PF04691502	Empty
Empty	101-31-5	1013-69-0	1013750-77-0	1013753-99-5	10138-52-0	1013920-15-4	1013937-63-7	1014691-61-2	101477-54-7	101494-95-5	Empty
Empty	L-Hyoscyamine	Noreugenin	ML-030	BC-1382	Gadolinium chloride	Vorolanib	VTP-27999 TFA	GSK0660	Lomerizine hydrochloride	8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE	Empty

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