一、平台概况
中医药几千年的发展历史证明了自身的价值和优势,是中国优秀传统文化的重要组成部分。现代中医药与先进科技手段的结合,已经为人民群众医疗卫生和健康服务事业做出了巨大贡献,还将在未来医学和整合医学的发展中发挥更大作用。中医药能够取得长足进步的基础在于产业振兴,关键在于融合创新,未来在于价值提升。
根据国家一系列中医药创新发展利好政策和时代发展的需求,中国中医科学院中药研究所整合药理学研究团队以中医优势病种为切入点,瞄准全球医药健康发展前沿,聚焦主要健康需求和生物医药重要品种,建立完善了“中医药百科全书(ETCM, http://www.tcmip.cn/ETCM)”、“中医药整合药理学网络计算平台(TCMIP, http://www.tcmip.cn/)”和“中医证候本体及多维定量关联性计算平台(SoFDA,http://www.tcmip.cn/Syndrome)”等系列多学科交叉研究和转化应用平台,及相应的支撑保障体系,为揭示中医药理论的科学内涵、提升中医原创思维的科学价值、总结与传承名医经验、中药质量控制、中药作用原理阐释、中药新药研发、尤其是现代药物组合发现与优化等,提供强有力的数据基础与分析工具。在此基础上,本团队还致力于搭建“中药活性成分发现和辨识、中药质量标志物的确认、基于细胞-动物-临床多层次整合的中药药效评价、中药多靶点复杂调控机制研究”等多维实验验证平台,以进一步夯实大数据挖掘结果,全面提升中医药物创新、中医诊疗创新的基础研究和转化应用能力,更好地服务于中医药健康产业发展和提高中医临床诊疗水平。截止目前,上述数据挖掘平台(ETCM、TCMIP、SoFDA)已被全球188个国家或地区访问,访问量超过32万次,结合多维实验验证平台的相关研究结果,已经发表中文核心论文163篇,SCI论文122篇,授权专利12项。
本公司拥有开展中药分析、中药药理、分子生物学等实验所需仪器及实验条件,包括细胞培养、共聚焦显微镜、超净工作台、高(超)速高心机、超低温冰箱、酶标仪、紫外分光光度仪、荧光倒置显微镜、共聚焦显微镜及图象处理系统、荧光实时定量PCR仪、各式电泳仪,液氮容器,动物剃毛机,电子秤,石蜡切割机,超薄切片机等。项目组成员来自于中医学、中药学、系统生物学、生物信息学、化学生物学、分子生物学等多个领域,研究人员结构合理,是一支多学科交叉的科研队伍,可以在多层次上进行沟通、交流和融合,是项目得以顺利完成的有利条件。
二、平台所具备的关键技术群
1. 中药/方剂全成分谱的快速解析技术
⑴ 基于TCMIP和国内外参考文献数据库,全面收集和整理目标方药所含的化学成分信息;
⑵ 基于UPLC-MS/MS目标方药全成分谱的定性鉴别;
⑶ 基于数学计算的目标方药所含化学成分谱的体内ADME特征评估;
⑷ 基于UPLC-MS/MS目标方药入血成分谱的定性鉴别。
图1. 方药化学成分谱的定性鉴别
2. 基于“病-证-症-方-靶”的异质网络关联分析
⑴ 基于TCMIP预测化学成分的候选靶标谱;
⑵ 基于TCMIP收集目标疾病的基因集;
⑶ 基于SoFDA收集证候的主、次症相关分子集;
⑷ 基于“疾病分子/证候分子-方药靶标”互作网络挖掘的目标方药“病-证-症-方-靶”关联的核心功能模块解析、核心靶标筛选及其上游调控关键成分的辨识等多层次的网络解析。
图2. 目标方药“病-证-症-方”关联的核心功能模块解析
图3. “病-证-症-方-靶”核心靶标筛选及候选质量标志物辨识
3. 基于细胞/动物模型评价方药及代表性成分的药效,并验证其网络调控机制
⑴ 神经病理性疼痛CCI模型(慢性疼痛);
⑵ 心脑血管疾病模型(大脑中动脉闭塞MCAO模型,冠状动脉左前降支结扎模型);
⑶ 难治性骨病(类风湿关节炎,骨性关节炎,非创伤性股骨头坏死,骨质疏松);
⑷ 代谢性疾病(糖尿病肾病,膜性肾病,肾损伤伴大量蛋白尿,酒精性肝损伤);
⑸ 实体肿瘤(肝纤维化肝癌,原发性肝癌,前列腺癌,脑胶质瘤);
⑹ 神经元、小胶质细胞、星型胶质细胞、心肌细胞的糖氧剥夺模型;
⑺ 小胶质细胞细胞焦亡;细胞H2O2损伤;LPS炎症模型。
图4. 大鼠神经病理性疼痛模型及评价
图5. 大鼠脑缺血再灌注经典模型及评价
图6. 小鼠心肌缺血再灌注经典模型及评价
图7. 类风湿关节炎经典动物模型疾病严重度评价
图8. 药物对糖尿病肾病体内大鼠动物模型的药效和作用机制研究
图9. 药物对膜性肾病小鼠动物模型的药效和作用机制研究
图10. 药物对DEN诱导型肝纤维-肝癌动态演变大鼠模型的药效和机制研究
图11. 药物对原位肝癌裸鼠模型的药效和机制研究
图12. 药物对急性肝损伤小鼠模型的药效评价
图13. 类风湿关节炎靶细胞人成纤维滑膜细胞的焦亡/炎性诱导和给药
图14. 类风湿关节炎靶细胞小鼠巨噬细胞(RAW264.7)的焦亡/炎性诱导和给药
图15. 药物对C5b-9致MPC-5足细胞损伤的影响
图16. 药物对人肝癌细胞(HEPG2、MHCC-97H等)功能的影响和作用机制
图17. 药物对人脑胶质瘤细胞(U87和U251等)功能的影响和作用机制
图18. 转录组数据解析。
图19. 基于动物模型的靶点验证。
图20. 基于/细胞模型的靶点验证。