ZNF蛋白筛选化合物库

Zinc Nuclear Finger (ZNF) Protein Screening Library

产品编号： LF2230

锌指（ZNF）蛋白是一类具有指结构域的转录因子。它们参与调控多种生物过程，包括转录控制、转录后调控以及促进蛋白质间相互作用。多种“锌指”结构域能够与DNA、RNA、PAR（聚ADP核糖）及其他蛋白质相互作用。因此，ZNFs参与了泛素介导的蛋白质降解、信号转导、肌动蛋白靶向、DNA修复、细胞迁移、脂质代谢、细胞分化及免疫反应等转录调控。ZNF蛋白的这种多功能性为药物发现提供了广泛的机会，使研究人员能够特异性靶向ZNF蛋白，并影响众多关键的细胞过程。

随着对ZNF蛋白科学理解的不断深入，它们逐渐成为现代药物发现中具有潜力但相对未被充分探索的靶点。Life Chemicals的化学信息学团队精心设计了专门的筛选集，包含超过2500种具有潜在选择性靶向锌指蛋白的类药筛选化合物：

ZNF蛋白聚焦集（2000种化合物）

ZNF蛋白靶向集（500种化合物）

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陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

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产品描述

背景 ZNF蛋白以其独特的DNA结合基序为特征，这些基序包括C2H2、LIM、RING和PHD。其中，ZNF蛋白中最普遍的是C2H2基序，通常位于相关蛋白的C末端。其特点在于具有CX2CX3FX5LX2HX3H的共识序列，主要由疏水性残基组成，除了C2H2位置。在ZNF蛋白的众多功能中，作为转录因子的作用是最为丰富且被广泛研究的。这些蛋白能够识别特定的DNA序列，从而促进或抑制转录。此外，ZNF蛋白在促进蛋白质间相互作用中也扮演着关键角色。一些ZNF蛋白作为转录后调控因子，具有RNA结合特性，主要与mRNA的成熟相关。值得注意的是，ZNF蛋白在多种疾病的发病机制中起着复杂的作用，尤其是神经退行性疾病如阿尔茨海默病和帕金森病，这使得它们成为与这些问题相关的代谢途径中的重要靶点。例如，它们通过抑制ZNF179在阿尔茨海默病中发挥作用，而在帕金森病中，每当ZNF746过表达时，都会显示出显著的效果。此外，在脊髓性肌萎缩症（SMA）的案例中，ZNF家族的ZNF1蛋白充当了SMN1基因的保护者。
库设计 1、ZNF蛋白聚焦集为创建此筛选库，首先从ChEMBL数据库中提取了超过47,000种具有记录在案的ZNF抑制活性的化合物作为参考集（IC50、Ki等小于10 μM，抑制率大于50%）。接着，使用二维指纹相似性搜索（Tanimoto指数大于0.85）对Life Chemicals高通量筛选化合物库进行分析，与获得的参考集进行比对。随后，通过径向指纹内部差异性搜索（Tanimoto指数大于0.85）进一步多样化化合物选择，以增强筛选化合物的结构多样性。最终，筛选出的化合物经过内部药物化学过滤器处理，以排除含有PAINS（泛测定干扰化合物）、毒性基团和反应性部分的化合物，成功获得了超过2000个类药分子。 2、ZNF蛋白靶向集 RNF31，亦称HOIP，是线性泛素链组装复合体（LUBAC）的关键组成部分。作为一种E3泛素-蛋白连接酶，RNF31在将线性（“Met-1”连接的）多聚泛素链共价结合到底物上起着核心作用。这一酶活性对于多种细胞信号传导途径至关重要，特别是在介导NF-κB的激活过程中，这对于调节免疫和炎症反应极为重要。从结构上看，该蛋白包含多个RING指结构域，这些结构域存在于多种功能各异的蛋白质中，并被认为参与DNA的相互作用。基于分子对接结果，从Life Chemicals高通量筛选化合物库中精心筛选出一组512种潜在的RING相互作用配体。化合物筛选过程极为谨慎，重点选择具有高效能和强结合作用的配体。主要特点：（1）方法：高通量虚拟筛选（对接），分子拟合（2）使用的X射线数据：4LJP （3）使用的过滤器：无（4）选定的化合物数量：512

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化合物库组成

化合物库信息示例

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