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tubulin_library
/library/tubulin_library
微管靶向化合物库EN
Tubulin Library From Enamine
产品编号: EN4200

使用分子对接、2D相似性和拓扑类似物搜索、分子和结构过滤等复杂方法,设计了针对微管蛋白的库。微管蛋白库包含3200个化合物。

https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/tubulin-targeted-library

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

最近在PDB中记录的蛋白质结构被认为是最适合进行计算筛选的,其中包括4YJ2、5C8Y和5CA1。所有三个微管蛋白结构中的蛋白质-配体相互作用的主要特征非常相似,并且可以进行叠加。因此,基于结合口袋中关键氨基酸残基的特征和分析蛋白质结构中观察到的配体相互作用,构建了蛋白质对接模型。对接模型已经通过一组已知活性化合物(110个配体)和非活性分子进行了验证。根据参考化合物集的活性数据进行了计算约束的修正。

2D相似性搜索和拓扑类似物搜索:

  1. 参考化合物集从可用的文献来源和数据库(如ChEMBL、BindingDB、PubChem)中进行了精心编制。
  2. 使用Tanimoto相似性范围为95-80%进行了化合物的选择。
  3. 使用拓扑场和生物同位素基团替代搜索了最有效的微管蛋白抑制剂的类似物。

应用于库的过滤器:

  1. 应用了内部开发的MedChem过滤器,用于对Enamine库存化合物集进行预选;
  2. 包括PAINS、Eli Lilly、REOS和普通功能团过滤器;
  3. 完全符合五项规则。
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化合物库组成
化合物库信息示例
Empty 1000025-07-9 1000413-72-8 229005-80-5 1000787-75-6 946387-07-1 1000998-59-3 1175526-27-8 1001288-58-9 1001350-96-4 1001404-83-6 Empty
Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
Empty 1001625-82-6 1001645-58-4 1001753-24-7 1001908-89-9 1002304-34-8 1002-84-2 100291-86-9 100299-08-9 10030-52-1 10040-45-6 Empty
RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
Empty 100427-26-7 1004316-88-4 10045-45-1 100462-37-1 1004990-28-6 100-51-6 1005-24-9 1005264-47-0 1005334-57-5 1005342-46-0 Empty
Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
Empty 100872-83-1 100874-08-6 1009119-64-5 1009119-65-6 100929-71-3 1009298-09-2 1009298-59-2 100929-99-5 1009734-33-1 10097-84-4 Empty
ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
Empty 1009816-48-1 1009817-63-3 1009820-21-6 100986-85-4 101001-34-7 1010411-21-8 1010-60-2 1011244-68-0 1011301-27-1 1011529-10-4 Empty
Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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Milnacipran hydrochloride BW-A78U Tenovin-6 DL-Normetanephrine hydrochloride Triclocarban CUDC101 Chlorpropham Mestinon Zacopride hydrochloride PF04691502
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L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE
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