骨架多样性精选库

Scaffold Diversity Curated Library

产品编号： CB3000

骨架多样性精选库包含 7162个独特分子，涵盖了 6941个结构相似性聚类簇和 3563个Bemis-Murcko框架。该库旨在为药物发现、化学信息学研究和分子库构建提供广泛且多样化的化学空间覆盖。通过精心设计和筛选，让整个库包含多种独特骨架结构的同时保持较小的规模，减少初期筛选的时间与成本，从而提高药物开发的效率和成功率。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述优势介绍

7162个分子：这些分子经过严格筛选，确保高质量和高多样性。
6941个结构相似性聚类簇：基于Tanimoto相似性指数进行聚类，每个簇内的分子具有高度的结构相似性，而不同簇之间的分子则具有显著的差异。
3563个Bemis-Murcko框架：涵盖了广泛的分子骨架类型，从简单的链状结构到复杂的多环系统，确保对化学空间的全面覆盖，为不同靶点提供更多的结构可能性。
符合 Lipinski 五规则和 Veber 标准，具有较高的成药潜力；
剔除PAINS和不稳定的分子结构，减少筛选假阳性率；
NMR/LCMS检测，确保产品结构正确，纯度高，减少假阳性。

优势介绍

骨架多样性精选库符合Lipinski规则，具备良好的成药潜力：

分子量范围300-500，剔除分子量过小的简单分子，减少非特异阳性分子出现的概率，剔除分子量过大的复杂分子，分子更易透过细胞膜，并能降低后续结构改造难度。
氢键受体数范围1-9，控制氢键受体的数量有助于提高化合物的膜通透性和溶解性，从而改善口服吸收。
氢键供体数范围0-5，提高化合物的膜通透性，从而改善口服吸收。

良好的溶解性质：

cLogP范围-4.5~6，主要集中分布于0~4之间。较高的LogP值具有更好的脂溶性，更易透过细胞膜，较低的LogP值具有更好的水溶性，使药物分子更易被吸收。本库的cLogP范围选取适中，在亲脂性和水溶性之间体现较好的平衡。
LogSw范围-8~1，主要集中分布于-4~0之间。LogSw在-4~0之间的化合物水溶性更好。

符合Veber规则，具有良好的口服生物利用度特性：

可旋转键数量范围0~10，主要集中在3~6之间，保持适度的分子刚性，提高结合特异性和生物活性，
拓扑极性表面积范围6~150，主要集中在40~120之间，控制化合物的极性特征，减少与水分子的过度相互作用，提高膜通透性。

优异的结构多样性，两种多样性挑选方式，提升化合物库结构多样性：

相似性聚类分析：基于MACCS分子指纹，通过70%的Tanimoto相似性阈值聚类分析，挑选结构差异性明显的化合物。本库的聚类簇（Cluster）中有6799个簇仅包含一个化合物，不同化合物之间具有较显著的差异性。
Bemis Murcko框架分析：将所有分子分解为其核心骨架和侧链部分，突出其关键结构特征，为每个分子生成Bemis Murcko框架。再对同框架的分子进行多样性挑选，其中2473个Bemis Murcko框架仅挑选1个对应分子，512个Bemis Murcko框架仅挑选2个对应分子。

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化合物库组成

化合物库信息示例

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