数量多:含2.3万种小分子化合物,是再生医学相关研究的有力工具;再生医学从诞生起就备受瞩目,修复受损的组织和器官,给医学界带来巨大的变革。不过再生医学领域依然处在起步阶段,对细胞分化机制的研究还不够全面和清晰,再生医学走向临床似乎还有很长的路。不过随着小分子成功调节细胞分化和重编程,再生医学领域又有了新的曙光。目前已报道多种小分子化合物具有促进细胞增殖分化的作用,如 XMU-MP-1可以促进肝脏修复再生,处于临床阶段的 FX-322能够恢复神经性听力损失。另外还有多种小分子同时使用能够诱导体细胞重编程的相关报导。与细胞因子与基因工程等相比,小分子调节剂用于再生医学研究和临床应用的难度更低,并且更有可能大规模生产和使用,惠及全人类。
陶术生物再生医学靶向库基于现有化合物和靶点的基础上,通过计算机虚拟筛选和药效结构分析等方法,从 Chemdiv 160万种类药化合物中筛选出约23000种潜在的再生医学调节剂。严格筛选是提高命中率的重要保证,再生医学靶向库同样经过了严格的筛选步骤。蛋白靶点和结构信息源自常用的 Swiss-Prot 和 PDB 数据库;大量分析学习各数据库(ChEMBL 25, PubMed 和现有文献)中明确报道的再生医学相关的活性小分子。具体筛选步骤如下:
1)计算机数据学习管理:a) KNIME/RDKit, kNN classifier, Distance in BitVector Cosine Space, FCFP12 (10,240 bit) fingerprints; b) Hybrid 2D QSAR/Fingerprint Model - Kernel Chemical Classification/Regression (kcc)
2)3D 形状相似性虚拟筛选;
3)基于结构的(配体,片段,共价片段)对接/虚拟筛选;
4)REOS,MedChem 和 PAINS 过滤器:去除反应性,有毒,混杂和其他不良结构基团;
5)多样性挑选 (Tanimoto)。
陶术生物再生医学靶向库可以用于再生医学相关的药物研发工作,为再生医学研究提供有力的研究工具。
Empty | 1000025-07-9 | 1000413-72-8 | 229005-80-5 | 1000787-75-6 | 946387-07-1 | 1000998-59-3 | 1175526-27-8 | 1001288-58-9 | 1001350-96-4 | 1001404-83-6 | Empty |
Vadadustat | TAK875 | TAK-779 | Tegobuvir | RN-1734 | BMS-687453 | AM211 | FT011 | BMS754807 | AAI101 | ||
Empty | 1001625-82-6 | 1001645-58-4 | 1001753-24-7 | 1001908-89-9 | 1002304-34-8 | 1002-84-2 | 100291-86-9 | 100299-08-9 | 10030-52-1 | 10040-45-6 | Empty |
RPW-24 | SRT1720 hydrochloride | INH6 | SRT 2183 | AMG208 | Pentadecanoic acid | Apiopaeonoside | Pemirolast potassium | L-Anserine nitrate salt | Sodium Picosulfate | ||
Empty | 100427-26-7 | 1004316-88-4 | 10045-45-1 | 100462-37-1 | 1004990-28-6 | 100-51-6 | 1005-24-9 | 1005264-47-0 | 1005334-57-5 | 1005342-46-0 | Empty |
Lercanidipine | Cobicistat | 1-Ethyl-2-benzimidazolinone | ROSIRIDIN | PF-AKT400 | Benzyl alcohol | 1-Methylnicotinamide chloride | MX69 | CVT-10216 | LCL161 | ||
Empty | 1005491-05-3 | 100-55-0 | 1005504-62-0 | 1005883-72-6 | 100643-71-8 | 1007207-67-1 | 10075-50-0 | 1007647-73-5 | 100784-20-1 | 10083-24-6 | Empty |
Tirasemtiv | Roniacol | Rg3039 | Z433927330 | Desloratadine | CH5132799 | 5-Bromoindole | Smurf1-IN-A01 | Halosulfuron-methyl | Piceatannol | ||
Empty | 100872-83-1 | 100874-08-6 | 1009119-64-5 | 1009119-65-6 | 100929-71-3 | 1009298-09-2 | 1009298-59-2 | 100929-99-5 | 1009734-33-1 | 10097-84-4 | Empty |
ML346 | SB 4 | Daclatasvir | Daclatasvir dihydrochloride | NADPH (tetracyclohexanamine) | AZD8055 | Vistusertib | PAβN dihydrochloride | HZ1157 | Rotundine | ||
Empty | 1009816-48-1 | 1009817-63-3 | 1009820-21-6 | 100986-85-4 | 101001-34-7 | 1010411-21-8 | 1010-60-2 | 1011244-68-0 | 1011301-27-1 | 1011529-10-4 | Empty |
Thiamet G | B-AP15 | Silmitasertib | Levofloxacin | Pamicogrel | GSK369796 Dihydrochloride | 2-Chloronaphthoquinone | TFAP | Tenovin3 | Azvudine | ||
Empty | 101152-94-7 | 101155-02-6 | 1011557-82-6 | 1011-74-1 | 101-20-2 | 1012054-59-9 | 101-21-3 | 101-26-8 | 101303-98-4 | 1013101-36-4 | Empty |
Milnacipran hydrochloride | BW-A78U | Tenovin-6 | DL-Normetanephrine hydrochloride | Triclocarban | CUDC101 | Chlorpropham | Mestinon | Zacopride hydrochloride | PF04691502 | ||
Empty | 101-31-5 | 1013-69-0 | 1013750-77-0 | 1013753-99-5 | 10138-52-0 | 1013920-15-4 | 1013937-63-7 | 1014691-61-2 | 101477-54-7 | 101494-95-5 | Empty |
L-Hyoscyamine | Noreugenin | ML-030 | BC-1382 | Gadolinium chloride | Vorolanib | VTP-27999 TFA | GSK0660 | Lomerizine hydrochloride | 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE |