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protein_mimetics_library
/library/protein_mimetics_library
蛋白结构模拟物化合物库
Protein Mimetics Library From Enamine
产品编号: EN3700

人体蛋白质组中已经确定了超过250,000个独立的蛋白质相互作用(PPIs)。尽管其中许多表现出拓扑复杂和庞大的表面区域,但在许多情况下,成功的结合是通过有限数量的关键残基("热点")实现的。有多篇文献报道了开发小分子调节蛋白质相互作用(PPIs)的计算和多样性导向方法。其中,非肽类α螺旋和β折叠模拟物尤其重要,因为它们在多个失调的通路中起着关键作用,导致癌症、神经退行性疾病、炎症和免疫紊乱等疾病的发生。蛋白质模拟库包含8960个化合物。

https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/ppi-library/protein-mimetics-library

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

基于靶向的方法,我们设计了一套针对选择的α螺旋结构域和β折叠的化合物。例如,mdm2-p53、mdm2-CK1α、HIF1-α、MEF2-HDAC4、HIV-1 gp41、CD81/CV、Bcl-2/Bcl-xL等。在虚拟筛选后,优先选择具有新的化学类型的结构。

传统的三个残基方法。包括设计具有异常核心的化合物,其上的常规关键残基模拟了位于一个识别面上(“热点”)的i、i+3/i+4和i+7残基。在建模α螺旋界面时,我们还考虑了双面螺旋模拟物。对于β折叠模拟物,我们应用了三个查询模型,涵盖不同类型的相互作用:π-π堆叠、阳离子-π和氢键相互作用,以及S-π相互作用。后一种重点设计的实例是对Bim BH3结构域与Mcl-1和Bcl-2之间相互作用的建模,并鉴定具有高Fsp3特性的融合多氢化合的氮杂环。

基于配体的方法。选择与已知α螺旋和β折叠模拟物拓扑结构相似的新的化学类型。形状相似性和药效团筛选是库设计的主要工具。

特别选择了独特的富含Fsp3的骨架,其中包含阶梯状的环状骨架,以增强与目标α螺旋和β折叠基序的拓扑和药效团相互作用。

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化合物库组成
化合物库信息示例
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Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
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RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
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Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
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ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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