USP30化合物库

USP 30 library

产品编号： DP7690

ChemDiv 的USP30化合物库包含10000种筛选化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述

关键步骤：

清除具有不良特性的化合物：
用于清除 PAINS 的子结构过滤器。
使用不符合医疗化学要求的智能过滤器。
以机器学习模型为虚拟筛选，使用 AutoDock Vina 进行对接：
利用 ChEMBL32 数据库中的 USP30 活动数据建立 ECFP 指纹的机器学习模型 - 选择 10-20K化合物。使用 Qed 和多样性选择 (MaxMin 算法) 来筛选 (对接) 多样性和更高质量的结构。
使用 AutoDock Vina 对接 7K 最佳化合物。
根据估计的能量和配体效率 (LE) 作出最终选择。发现具有新型化学类型的非共价USP30抑制剂。关键决策/细节：
对所有可用的ChemDiv小分子库1.6M进行筛选，以获得PAINS、REOS和MedChem（包括Lipinski Ro5)结果，得到950K个结构。
使用ChEMBL32中的USP30活性数据构建了初始筛选的机器学习模型：基于13个描述符（包括例如cLogP、NumHDonors、NumHAcceptors、MolWt、MaxPartialCharge、拓扑指数Kappa3)建立的逻辑回归模型对CatBoost模型（使用所有可用描述符）在训练集上表现最为显著（可能过度拟合）。
使用逻辑回归模型筛选出最有可能是USP30活性的100K结构，其中结构的QE[1]>0.5用于进一步处理。
最后，使用MaxMin算法（ECFP2048）选择了一组10K最多样化的化合物。基于结构的筛选
选择了两个PDB结构进行建模。
5OHP与双泛素底物和催化C77A替换l 8D0A与小分子共价抑制剂（于2023年发布）。
定义结合口袋的环构象在结构上明显不同。
对每个受体模型进行AutoDock Vina对接。
最后，化合物显示与<7 kcal/mol的结合（由Vina估计），并且至少一个受体的LE >= 0.3。保留了模型，得到2680个前瞻性化合物。

化合物库定制

我们的化合物库可以灵活定制！了解更多

化合物库咨询

化合物库组成

化合物库信息示例

Empty	1000025-07-9	1000413-72-8	229005-80-5	1000787-75-6	946387-07-1	1000998-59-3	1175526-27-8	1001288-58-9	1001350-96-4	1001404-83-6	Empty
Empty	Vadadustat	TAK875	TAK-779	Tegobuvir	RN-1734	BMS-687453	AM211	FT011	BMS754807	AAI101	Empty
Empty	1001625-82-6	1001645-58-4	1001753-24-7	1001908-89-9	1002304-34-8	1002-84-2	100291-86-9	100299-08-9	10030-52-1	10040-45-6	Empty
Empty	RPW-24	SRT1720 hydrochloride	INH6	SRT 2183	AMG208	Pentadecanoic acid	Apiopaeonoside	Pemirolast potassium	L-Anserine nitrate salt	Sodium Picosulfate	Empty
Empty	100427-26-7	1004316-88-4	10045-45-1	100462-37-1	1004990-28-6	100-51-6	1005-24-9	1005264-47-0	1005334-57-5	1005342-46-0	Empty
Empty	Lercanidipine	Cobicistat	1-Ethyl-2-benzimidazolinone	ROSIRIDIN	PF-AKT400	Benzyl alcohol	1-Methylnicotinamide chloride	MX69	CVT-10216	LCL161	Empty
Empty	1005491-05-3	100-55-0	1005504-62-0	1005883-72-6	100643-71-8	1007207-67-1	10075-50-0	1007647-73-5	100784-20-1	10083-24-6	Empty
Empty	Tirasemtiv	Roniacol	Rg3039	Z433927330	Desloratadine	CH5132799	5-Bromoindole	Smurf1-IN-A01	Halosulfuron-methyl	Piceatannol	Empty
Empty	100872-83-1	100874-08-6	1009119-64-5	1009119-65-6	100929-71-3	1009298-09-2	1009298-59-2	100929-99-5	1009734-33-1	10097-84-4	Empty
Empty	ML346	SB 4	Daclatasvir	Daclatasvir dihydrochloride	NADPH (tetracyclohexanamine)	AZD8055	Vistusertib	PAβN dihydrochloride	HZ1157	Rotundine	Empty
Empty	1009816-48-1	1009817-63-3	1009820-21-6	100986-85-4	101001-34-7	1010411-21-8	1010-60-2	1011244-68-0	1011301-27-1	1011529-10-4	Empty
Empty	Thiamet G	B-AP15	Silmitasertib	Levofloxacin	Pamicogrel	GSK369796 Dihydrochloride	2-Chloronaphthoquinone	TFAP	Tenovin3	Azvudine	Empty
Empty	101152-94-7	101155-02-6	1011557-82-6	1011-74-1	101-20-2	1012054-59-9	101-21-3	101-26-8	101303-98-4	1013101-36-4	Empty
Empty	Milnacipran hydrochloride	BW-A78U	Tenovin-6	DL-Normetanephrine hydrochloride	Triclocarban	CUDC101	Chlorpropham	Mestinon	Zacopride hydrochloride	PF04691502	Empty
Empty	101-31-5	1013-69-0	1013750-77-0	1013753-99-5	10138-52-0	1013920-15-4	1013937-63-7	1014691-61-2	101477-54-7	101494-95-5	Empty
Empty	L-Hyoscyamine	Noreugenin	ML-030	BC-1382	Gadolinium chloride	Vorolanib	VTP-27999 TFA	GSK0660	Lomerizine hydrochloride	8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE	Empty

注册成功