3D片段化合物库LF

LF 3D-shaped Fragment Library

产品编号： LF8000

分子形状，尤其是其三维形态，是生物分子识别特定几何结构并与之结合位点产生亲和力的基本前提之一。然而，现有药物大多以较为平坦且富含sp2杂化的芳香核为中心。此外，相同的核心结构常出现在针对不同疾病的多种药物中，导致特异性（选择性）较低，并增加了副作用的发生。尽管大多数片段库提供了高度的多样性，并经过优化以平衡各项性质，但它们往往在形状多样性方面存在局限。

在此背景下，已确认分子具有更高的三维性（3D）是药物候选分子的理想特性，并且是影响分子在临床开发各阶段成功通过的决定性因素之一。使用更复杂、更富三维性的富含sp3的片段无疑将扩展药物样片段的化学空间，这反过来可能有利于探索更具挑战性的生物靶标。

鉴于上述情况，Life Chemicals 精心设计了一个专有的三维形状片段库，包含15,000个非平面类片段分子，以支持高效的基于片段的药物发现（FBDD）。筛选过程着重于物理化学性质和描述符，这些性质和描述符能够评估类片段筛选化合物的三维维度和结构多样性。该筛选集涵盖了多种分子形状：棒状、盘状和球状，并在二维归一化PMI三角图中展示了足够的多样性。

此外，该片段筛选库还提供了一个新的3D片段子集，该子集根据缩小的PMI标准筛选，包含超过3800个3D分子。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述

库设计首先，使用几个过滤标准应用于Life Chemicals General Fragment库的Rule of Three。主惯性矩（PMI）计算被用作一种高效的方法来计算和评估3D维度。通过应用最大Tanimoto多样性系数85％（使用线性指纹），证明了库的适当多样性水平。通过应用PAINS和我们独有的内部药物化学过滤器，消除了不良的功能基团。总共选择了约3,800个可供使用的片段，代表了各种3D形状的分子。

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化合物库组成

化合物库信息示例

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Empty	ML346	SB 4	Daclatasvir	Daclatasvir dihydrochloride	NADPH (tetracyclohexanamine)	AZD8055	Vistusertib	PAβN dihydrochloride	HZ1157	Rotundine	Empty
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Empty	Thiamet G	B-AP15	Silmitasertib	Levofloxacin	Pamicogrel	GSK369796 Dihydrochloride	2-Chloronaphthoquinone	TFAP	Tenovin3	Azvudine	Empty
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Empty	Milnacipran hydrochloride	BW-A78U	Tenovin-6	DL-Normetanephrine hydrochloride	Triclocarban	CUDC101	Chlorpropham	Mestinon	Zacopride hydrochloride	PF04691502	Empty
Empty	101-31-5	1013-69-0	1013750-77-0	1013753-99-5	10138-52-0	1013920-15-4	1013937-63-7	1014691-61-2	101477-54-7	101494-95-5	Empty
Empty	L-Hyoscyamine	Noreugenin	ML-030	BC-1382	Gadolinium chloride	Vorolanib	VTP-27999 TFA	GSK0660	Lomerizine hydrochloride	8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE	Empty

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