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lf_3d-shaped_fragment_library
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3D片段化合物库LF
LF 3D-shaped Fragment Library
产品编号: LF8000

已经确定,分子的较高三维性(3D)是候选药物的理想特征,并与分子在临床开发的各个阶段成功通过相关。使用更复杂、更具3D 特征的 sp³富集片段无疑会扩大药物样式片段的化学空间,这可能在探索更具挑战性的生物靶点方面具有优势。3D 形状的片段库包含3100个化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

分子形状是生物分子识别和与结合位点的亲和性之间的重要因素之一。然而,绝大多数现有药物都以富含sp2的芳香核为中心。此外,通常可以在多种针对不同疾病的药物中找到相同的核心基团,这导致了低特异性(选择性)和副作用的增加。尽管大多数片段库提供了高水平的多样性,并且经过精细调整以包含正确的属性平衡,但它们在形状多样性方面往往具有局限性。鉴于上述情况,我们精心设计了我们的3D 片段库,使用可以评估分子的3D维度和多样性的物理化学性质和描述符。

库设计 首先,使用几个过滤标准应用于Life Chemicals General Fragment库的Rule of Three。主惯性矩(PMI)计算被用作一种高效的方法来计算和评估3D维度。通过应用最大Tanimoto多样性系数85%(使用线性指纹),证明了库的适当多样性水平。通过应用PAINS和我们独有的内部药物化学过滤器,消除了不良的功能基团。总共选择了约3,100个可供使用的片段,代表了各种3D形状的分子。

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化合物库组成
化合物库信息示例
Empty 1000025-07-9 1000413-72-8 229005-80-5 1000787-75-6 946387-07-1 1000998-59-3 1175526-27-8 1001288-58-9 1001350-96-4 1001404-83-6 Empty
Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
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RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
Empty 100427-26-7 1004316-88-4 10045-45-1 100462-37-1 1004990-28-6 100-51-6 1005-24-9 1005264-47-0 1005334-57-5 1005342-46-0 Empty
Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
Empty 1005491-05-3 100-55-0 1005504-62-0 1005883-72-6 100643-71-8 1007207-67-1 10075-50-0 1007647-73-5 100784-20-1 10083-24-6 Empty
Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
Empty 100872-83-1 100874-08-6 1009119-64-5 1009119-65-6 100929-71-3 1009298-09-2 1009298-59-2 100929-99-5 1009734-33-1 10097-84-4 Empty
ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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Milnacipran hydrochloride BW-A78U Tenovin-6 DL-Normetanephrine hydrochloride Triclocarban CUDC101 Chlorpropham Mestinon Zacopride hydrochloride PF04691502
Empty 101-31-5 1013-69-0 1013750-77-0 1013753-99-5 10138-52-0 1013920-15-4 1013937-63-7 1014691-61-2 101477-54-7 101494-95-5 Empty
L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE
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