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epigenetics_library
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表观遗传靶向化合物库
Epigenetics Library From Enamine
产品编号: EN2300

近年来,在表观遗传学领域的新发现为除了DNA序列之外的遗传信息如何调控生物体功能提供了坚实的分子基础。我们公司为客户提供一系列聚焦于几类表观遗传靶点的化合物库:组蛋白去乙酰化酶(HDACs)、组蛋白甲基转移酶(HMT)、DNA甲基转移酶(DNMT)、溴结构域。表观遗传学库包含38080个化合物。

https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/epigenetics-libraries

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

由于表观遗传靶点类别的极端多样性,使用了不同的方法来创建该库。每个表观遗传靶点类别都包含多个不同的家族,应该分别对待。在创建库时,主要思想是创建针对特定家族的化合物库,而不是特定的分子靶点靶向。这种方法基于将来自相似家族的分子靶点根据其结合位点的信息(包括位点的空间结构、氨基酸组成等)划分为一组聚类,从而使我们能够建立描述靶点家族和其与配体的相互作用特异性的配置文件。这些数据为选择最具代表性的质心蛋白结构提供了坚实的基础,并允许构建初步的药效团模型,以过滤掉那些没有足够结构特征显示良好结合的化合物。下一步包括进一步减少需要进行对接过程的化合物数量的先进三维药效团模型创建。接下来进行分子对接,最后对所得结果进行精确调整和可视化检查。

为了创建每个靶点类别的库,采用了结合了基于配体和基于受体的方法的综合方法。因此,通用的流程图可以表示如下:

  1. 分析所有可用的结构数据(PDB、文献来源等)。
  2. 创建和验证药效团模型。
  3. 利用相互作用关键点、限定体积和空间构象要求进行高级药效团搜索。
  4. 分子对接。
  5. 对获得的结果进行精确调整和可视化检查。

这种方法可以创建出在探索程度较低的靶点的早期研究中具有无价值的工具,从而有机会发现对目标具有高亲和力的化合物。因此,为进一步的命中探索步骤提供坚实的基础,研究人员可以在这一步骤中专注于增加命中化合物对目标家族其他代表的特异性。

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化合物库组成
化合物库信息示例
Empty 1000025-07-9 1000413-72-8 229005-80-5 1000787-75-6 946387-07-1 1000998-59-3 1175526-27-8 1001288-58-9 1001350-96-4 1001404-83-6 Empty
Vadadustat TAK875 TAK-779 Tegobuvir RN-1734 BMS-687453 AM211 FT011 BMS754807 AAI101
Empty 1001625-82-6 1001645-58-4 1001753-24-7 1001908-89-9 1002304-34-8 1002-84-2 100291-86-9 100299-08-9 10030-52-1 10040-45-6 Empty
RPW-24 SRT1720 hydrochloride INH6 SRT 2183 AMG208 Pentadecanoic acid Apiopaeonoside Pemirolast potassium L-Anserine nitrate salt Sodium Picosulfate
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Lercanidipine Cobicistat 1-Ethyl-2-benzimidazolinone ROSIRIDIN PF-AKT400 Benzyl alcohol 1-Methylnicotinamide chloride MX69 CVT-10216 LCL161
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
Empty 100872-83-1 100874-08-6 1009119-64-5 1009119-65-6 100929-71-3 1009298-09-2 1009298-59-2 100929-99-5 1009734-33-1 10097-84-4 Empty
ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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Thiamet G B-AP15 Silmitasertib Levofloxacin Pamicogrel GSK369796 Dihydrochloride 2-Chloronaphthoquinone TFAP Tenovin3 Azvudine
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Milnacipran hydrochloride BW-A78U Tenovin-6 DL-Normetanephrine hydrochloride Triclocarban CUDC101 Chlorpropham Mestinon Zacopride hydrochloride PF04691502
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L-Hyoscyamine Noreugenin ML-030 BC-1382 Gadolinium chloride Vorolanib VTP-27999 TFA GSK0660 Lomerizine hydrochloride 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE
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