炎症性疾病-胞质磷脂酶 A2（cPLA2）抑制剂库

cPLA2 inhibitors

产品编号： DS4000

胞质磷脂酶A2（cPLA2）是一种在膜磷脂代谢和花生四烯酸生成中起关键作用的酶，花生四烯酸是前列腺素和白三烯等多种生物活性脂质的前体。这些代谢物是炎症反应的主要成分，因此cPLA2成为抗炎药物开发的潜在靶点。cPLA2抑制剂在药物发现中扮演着重要角色，因其在治疗各种炎症性疾病中的潜力。cPLA2作为花生四烯酸途径中的关键酶，参与前列腺素和白三烯等促炎介质的生成。通过抑制cPLA2，这些药物旨在减少这些介质的合成，从而缓解炎症及相关症状。这使得cPLA2抑制剂成为哮喘、类风湿性关节炎及其他慢性炎症性疾病的有望候选药物。此外，其在神经退行性疾病和癌症临床实践中的潜力也正在研究中，其中炎症是疾病进展的关键因素。

ChemDiv的cPLA2抑制剂库包含超过5000种化合物。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(2.8MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述

该库根据以下策略设计： -分析ChEMBL数据库中的cPLA2抑制剂数据，包含399种配体，作为开发基于配体的虚拟筛选集的主要支架来源； -利用人类cPLA2晶体结构进行基于结构的设计。上述策略通过以下工作流程在库构建中实施： -排除具有不良物理化学特性的化合物； -通过子结构过滤去除泛测定干扰化合物（PAINs）； -基于非药物化学友好SMARTS的过滤； -排除高亲脂性化合物（由Molsoft软件预测的cLogP）； -采用基于配体的方法和分子对接相结合的虚拟筛选程序； -使用“最小-最大”算法进行结构多样性驱动的化合物选择。配体开发方法： -基于ICM模型预测的亲脂性值（cLogP）进行库存收集筛选； -初始分类机器学习（ML）模型驱动的虚拟筛选过滤； -使用ChEMBL数据库作为训练数据源，该数据库包含399条已知cPLA2抑制剂生物活性的相关数据记录。训练集中的诱饵采用DUD-E方法生成，而测试集中的诱饵则从ChEMBL数据中整理。 -部署了两个独立的ML模型：一个基于计数型Morgan指纹构建的随机森林模型，以及一个基于ECFP4指纹构建的XGBoost模型。 -这些模型预测的化合物及其相关评分被汇编为最终结果。 -针对化学空间覆盖增强的多样性目标化合物选择； -从库存收集中基于配体的选择产生了约10万种多样化化合物，适合后续基于结构的研究。基于结构的研究使用了从蛋白质数据库（PDB）获得的数据，该数据库提供了一个具有所需CAP/Lid结构域的唯一结构（Uniprot ID P47712，PDB代码：1CJY）。Lid区域结构（PDB代码：1CJY）包含一些未解析的环和侧链，作为潜在的药物结合位点。使用FREAD方法对这些片段进行建模，然后进行更多的分子动力学研究以改进目标区域的采样。该过程的关键步骤包括： -使用OpenMM引擎在显式模拟的溶剂分子中进行10纳秒的分子动力学模拟，以提高Lid/CAP区域的采样； -使用ICM算法进行结合位点检测，重点关注在模拟中表现稳定的位点； -通过CAP区域的RMSD值对MD轨迹进行聚类，在对接研究中选出了三个最密集的簇； -使用Flare软件（Cresset）进行分子对接和评分； -实施互补的静电计算（Flare, Cresset）作为额外的基于结构的方法。基于结构的策略满足以下标准： -部署了10纳秒的分子动力学以采样结合位点构象 -使用共识对接法选择由分子动力学生成的三个最密集的簇 -补充的静电计算 -基于对接和静电计算的结构选择产生了约17,000个得分最高的化合物 -基于多样性的化合物选择产生了5,600个化合物 -基本物理化学性质的分布和代表性结构显示在上面的幻灯片中。

化合物库定制

我们的化合物库可以灵活定制！了解更多

化合物库咨询

化合物库组成

化合物库信息示例

Empty	1000025-07-9	1000413-72-8	229005-80-5	1000787-75-6	946387-07-1	1000998-59-3	1175526-27-8	1001288-58-9	1001350-96-4	1001404-83-6	Empty
Empty	Vadadustat	TAK875	TAK-779	Tegobuvir	RN-1734	BMS-687453	AM211	FT011	BMS754807	AAI101	Empty
Empty	1001625-82-6	1001645-58-4	1001753-24-7	1001908-89-9	1002304-34-8	1002-84-2	100291-86-9	100299-08-9	10030-52-1	10040-45-6	Empty
Empty	RPW-24	SRT1720 hydrochloride	INH6	SRT 2183	AMG208	Pentadecanoic acid	Apiopaeonoside	Pemirolast potassium	L-Anserine nitrate salt	Sodium Picosulfate	Empty
Empty	100427-26-7	1004316-88-4	10045-45-1	100462-37-1	1004990-28-6	100-51-6	1005-24-9	1005264-47-0	1005334-57-5	1005342-46-0	Empty
Empty	Lercanidipine	Cobicistat	1-Ethyl-2-benzimidazolinone	ROSIRIDIN	PF-AKT400	Benzyl alcohol	1-Methylnicotinamide chloride	MX69	CVT-10216	LCL161	Empty
Empty	1005491-05-3	100-55-0	1005504-62-0	1005883-72-6	100643-71-8	1007207-67-1	10075-50-0	1007647-73-5	100784-20-1	10083-24-6	Empty
Empty	Tirasemtiv	Roniacol	Rg3039	Z433927330	Desloratadine	CH5132799	5-Bromoindole	Smurf1-IN-A01	Halosulfuron-methyl	Piceatannol	Empty
Empty	100872-83-1	100874-08-6	1009119-64-5	1009119-65-6	100929-71-3	1009298-09-2	1009298-59-2	100929-99-5	1009734-33-1	10097-84-4	Empty
Empty	ML346	SB 4	Daclatasvir	Daclatasvir dihydrochloride	NADPH (tetracyclohexanamine)	AZD8055	Vistusertib	PAβN dihydrochloride	HZ1157	Rotundine	Empty
Empty	1009816-48-1	1009817-63-3	1009820-21-6	100986-85-4	101001-34-7	1010411-21-8	1010-60-2	1011244-68-0	1011301-27-1	1011529-10-4	Empty
Empty	Thiamet G	B-AP15	Silmitasertib	Levofloxacin	Pamicogrel	GSK369796 Dihydrochloride	2-Chloronaphthoquinone	TFAP	Tenovin3	Azvudine	Empty
Empty	101152-94-7	101155-02-6	1011557-82-6	1011-74-1	101-20-2	1012054-59-9	101-21-3	101-26-8	101303-98-4	1013101-36-4	Empty
Empty	Milnacipran hydrochloride	BW-A78U	Tenovin-6	DL-Normetanephrine hydrochloride	Triclocarban	CUDC101	Chlorpropham	Mestinon	Zacopride hydrochloride	PF04691502	Empty
Empty	101-31-5	1013-69-0	1013750-77-0	1013753-99-5	10138-52-0	1013920-15-4	1013937-63-7	1014691-61-2	101477-54-7	101494-95-5	Empty
Empty	L-Hyoscyamine	Noreugenin	ML-030	BC-1382	Gadolinium chloride	Vorolanib	VTP-27999 TFA	GSK0660	Lomerizine hydrochloride	8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE	Empty

注册成功