目前,共价结合抑制剂的使用正显著稳步增长,一系列分子正在经历不同阶段的临床试验,其中一些甚至已获得上市药品的地位。当前,半胱氨酸(Cys)和丝氨酸(Ser)是共价结合抑制剂开发的主要靶点,这主要归因于它们的高亲核性侧链,分别为硫醇盐和醇盐,在生理条件下具有活性。然而,半胱氨酸在蛋白质序列整体中,尤其是在蛋白质表面,相对较为罕见。相比之下,丝氨酸若不作为催化位点的一部分,则不太可能失去其质子,使其成为反应性较低的靶点。因此,人们正在努力探索其他氨基酸侧链作为抑制剂结合的选择性靶点。赖氨酸在蛋白质结合位点中的存在比半胱氨酸更为丰富,因此成为合理设计靶向共价抑制剂(TCIs)的有力候选者。主要挑战在于赖氨酸的亲核性较低,且在生理条件下通常处于质子化状态。尽管如此,赖氨酸残基的pKa值因其周围环境的影响而显示出显著变化。这种可变性为提高实现有效和靶向共价相互作用的可能性提供了机会。
共价赖氨酸结合化合物代表了一种新的药物发现方法,利用赖氨酸在蛋白质结合位点中的丰富存在来开发靶向疗法。通过与赖氨酸残基形成共价键,这些化合物具有创造高选择性和强效抑制剂的潜力,能够以增强的稳定性和延长的作用时间调节蛋白质功能。这种特异性在设计能够紧密且不可逆地结合其靶标的药物中尤为宝贵,减少了脱靶效应并提高了治疗效果。靶向赖氨酸残基的能力还为合理设计针对更广泛蛋白质的药物开辟了新途径,这些蛋白质以前难以靶向,从而扩大了可治疗疾病和病症的范围。
共价赖氨酸结合剂在多个治疗领域展现出显著前景,尤其在肿瘤学、传染病、神经退行性疾病、炎症性疾病和代谢紊乱方面具有特殊潜力。在肿瘤学中,它们提供了一种选择性抑制促癌蛋白的途径,可能减少耐药性和副作用的发生。对于传染病,它们可能催生针对病原体关键蛋白的新型抗菌和抗病毒药物,以应对抗生素耐药性问题。在神经退行性疾病领域,针对参与毒性聚集的蛋白质提供了一种对抗阿尔茨海默病和帕金森病等疾病的新策略。对于炎症性疾病,如类风湿性关节炎和炎症性肠病,共价赖氨酸结合剂可能提供更特异和更安全的治疗方法。最后,在代谢紊乱方面,它们有潜力调节与糖尿病和肥胖相关的关键酶,开辟新的治疗途径。这种广泛的适用性凸显了共价赖氨酸结合剂在现代医学中的变革潜力。
ChemDiv的小分子共价赖氨酸结合剂库包含4,200种化合物。
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Vadadustat | TAK875 | TAK-779 | Tegobuvir | RN-1734 | BMS-687453 | AM211 | FT011 | BMS754807 | AAI101 | ||
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RPW-24 | SRT1720 hydrochloride | INH6 | SRT 2183 | AMG208 | Pentadecanoic acid | Apiopaeonoside | Pemirolast potassium | L-Anserine nitrate salt | Sodium Picosulfate | ||
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Lercanidipine | Cobicistat | 1-Ethyl-2-benzimidazolinone | ROSIRIDIN | PF-AKT400 | Benzyl alcohol | 1-Methylnicotinamide chloride | MX69 | CVT-10216 | LCL161 | ||
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Tirasemtiv | Roniacol | Rg3039 | Z433927330 | Desloratadine | CH5132799 | 5-Bromoindole | Smurf1-IN-A01 | Halosulfuron-methyl | Piceatannol | ||
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ML346 | SB 4 | Daclatasvir | Daclatasvir dihydrochloride | NADPH (tetracyclohexanamine) | AZD8055 | Vistusertib | PAβN dihydrochloride | HZ1157 | Rotundine | ||
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Thiamet G | B-AP15 | Silmitasertib | Levofloxacin | Pamicogrel | GSK369796 Dihydrochloride | 2-Chloronaphthoquinone | TFAP | Tenovin3 | Azvudine | ||
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Milnacipran hydrochloride | BW-A78U | Tenovin-6 | DL-Normetanephrine hydrochloride | Triclocarban | CUDC101 | Chlorpropham | Mestinon | Zacopride hydrochloride | PF04691502 | ||
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L-Hyoscyamine | Noreugenin | ML-030 | BC-1382 | Gadolinium chloride | Vorolanib | VTP-27999 TFA | GSK0660 | Lomerizine hydrochloride | 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE |