反向找靶

反向找靶，也被称为反向对接、靶点垂钓等。对于化合物已知疗效，但是，并不知道该化合物产生效果的机制时候，一般会采用反向找靶的方法。同时，由于通量、精度和费用的限制, 实验手段的应用有时难以广泛开展。采用理论方法进行靶点预测，具有快速而低成本的特点，成为了一种重要的辅助手段。

常见的理论方法有：

1. 基于分子二维结构相似性的方法，该方法计算速度非常快，也不需要对小分子结构进行预处理。但是其预测结果取决于二维相似性的计算精确度，且不能预测训练集之外的未知结构

2. 基于分子三维结构相似性的方法，该方法计算速度也比较快，其考虑小分子的三维形状和药效团特征，可以预测训练集之外的未知结构。该方法不适用于activity cliff情况的预测（即化合物结构差异很小而生物活性差别很大）。

3. 基于反向分子对接的方法，该方法直接利用靶标结构信息，通过靶标与小分子的作用强度进行预测，但是，该方法计算速度比较慢、需要靶标三维结构、需要进行结构预处理、需要适合的评价函数。

4. 基于生物活性谱图分析的方法，该方法基于化合物生物活性谱的相似性进行预测，精度较高，但是，该方法需要获得待测化合物的生物活性谱图，同时不同来源的生物活性数据需要进行处理

反向找靶（反向对接、靶点垂钓）是中药研究、天然药化、有机化学研究者经常需要的方法，是目前对分子设计的补充，是研究分子机制的重要方法之一。

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